Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P3

LCE1B, Late cornified envelope protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE1BQ5T7P3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LCE1BQ5T7P3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms