Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL39P5Q59GN2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms