Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTBL2Q562R1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTBL2Q562R1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms