Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms