Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KNOP1Q1ED39 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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