Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC142Q17RM4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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