Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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PTPROQ16827 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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PTPROQ16827 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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PTPROQ16827 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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PTPROQ16827 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPROQ16827 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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