Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD1Q16676 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD1Q16676 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms