Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC6Q16204 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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