Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIK4Q16099 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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