Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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