Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA2Q15822 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNA2Q15822 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms