Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms