Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNHIT3Q15649 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms