Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRADDQ15628 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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