Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TCEA2Q15560 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms