Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3CQ15386 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3CQ15386 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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