Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RABEP1Q15276 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RABEP1Q15276 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms