Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDGFRLQ15198 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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