Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RAB39AQ14964 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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