Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF4GQ14541 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HNF4GQ14541 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms