Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms