Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCOA4Q13772 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCOA4Q13772 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms