Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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CUL4AQ13619 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CUL4AQ13619 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CUL4AQ13619 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL4AQ13619 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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