Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPM6BQ13491 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms