Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAD4Q13485 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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