Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GOLGA4Q13439 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms