Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PTGDRQ13258 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTGDRQ13258 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTGDRQ13258 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTGDRQ13258 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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