Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SEMA3BQ13214 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SEMA3BQ13214 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SEMA3BQ13214 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SEMA3BQ13214 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA3BQ13214 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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