Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SLC2A3-205ENST00000486749 4414 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.12e-12■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.22e-12■■■□□ 16.9
TARDBPQ13148 USP10-215ENST00000569038 730 ntTSL 311.5□□□□□ -0.578e-7■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 35.37□□□□□ -1.558e-7■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 521.72■■□□□ 1.071e-7■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 GSE1-216ENST00000637419 2683 ntTSL 519■□□□□ 0.631e-7■■■□□ 16.8
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TARDBPQ13148 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 16.8
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TARDBPQ13148 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 312.06□□□□□ -0.481e-7■■■□□ 16.8
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TARDBPQ13148 LINC00958-207ENST00000534477 888 ntTSL 38.22□□□□□ -1.092e-11■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-11■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 LINC00958-205ENST00000531402 590 ntTSL 44.69□□□□□ -1.662e-11■■■□□ 16.8
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TARDBPQ13148 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 322.56■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.071e-6■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 11e-6■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.861e-6■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 513.78□□□□□ -0.21e-6■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-7■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.893e-7■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 FGFR1OP-205ENST00000494781 460 ntTSL 312.4□□□□□ -0.424e-7■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 215.82■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 16.8
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TARDBPQ13148 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.28e-7■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.38e-7■■■□□ 16.8
TARDBPQ13148 TMEM63A-206ENST00000487817 660 ntTSL 218.3■□□□□ 0.524e-9■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 TMEM63A-202ENST00000436966 454 ntTSL 214.56□□□□□ -0.084e-9■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.554e-7■■■□□ 16.7
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TARDBPQ13148 ARHGAP21-203ENST00000396432 7167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-7■■■□□ 16.7
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TARDBPQ13148 TXNRD2-208ENST00000471835 326 ntTSL 22.34□□□□□ -2.033e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 16.7
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TARDBPQ13148 VAV1-209ENST00000601452 815 ntTSL 317.58■□□□□ 0.42e-9■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-9■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 C2orf42-212ENST00000470096 579 ntTSL 416.59■□□□□ 0.252e-9■■■□□ 16.7
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TARDBPQ13148 TIA1-212ENST00000477415 510 ntTSL 24.66□□□□□ -1.662e-9■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.983e-6■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-6■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 HOOK3-204ENST00000527306 2325 ntTSL 1 (best)20.42■□□□□ 0.869e-7■■■□□ 16.7
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TARDBPQ13148 UCHL5-203ENST00000367450 1355 ntTSL 519.5■□□□□ 0.713e-6■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-6■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 UCHL5-210ENST00000421683 834 ntTSL 310.81□□□□□ -0.683e-6■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.069e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.052e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 TSEN15-206ENST00000485209 806 ntTSL 321.42■■□□□ 1.022e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.972e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 TSEN15-202ENST00000367518 573 ntTSL 319.18■□□□□ 0.662e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.612e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 TSEN15-205ENST00000462677 1628 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.472e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.895e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.075e-7■■■□□ 16.7
TARDBPQ13148 UBE2G1-203ENST00000571980 984 ntTSL 521.86■■□□□ 1.093e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 UBE2G1-206ENST00000574633 863 ntTSL 220.45■□□□□ 0.863e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.293e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.53e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 UBE2G1-202ENST00000571953 553 ntTSL 37.63□□□□□ -1.193e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 CTBP2-207ENST00000467395 410 ntTSL 323.94■■□□□ 1.423e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 CTBP2-213ENST00000530930 425 ntTSL 511.1□□□□□ -0.633e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.629e-17■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 TAF1-202ENST00000373775 2199 ntTSL 59.51□□□□□ -0.897e-8■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 TAF1-205ENST00000437147 2295 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.957e-8■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.167e-8■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.177e-8■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-14■■■□□ 16.6
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