Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CALCOCO2Q13137 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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