Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms