Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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