Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF1Q13077 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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