Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MKRN3Q13064 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN3Q13064 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN3Q13064 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN3Q13064 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN3Q13064 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MKRN3Q13064 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
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