Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK3Q13003 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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