Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXF1Q12946 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXF1Q12946 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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