Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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FOXO1Q12778 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXO1Q12778 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXO1Q12778 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXO1Q12778 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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FOXO1Q12778 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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