Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
HMGXB3Q12766 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HMGXB3Q12766 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
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