Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGNL1Q0VF96 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms