Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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