Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CD300CQ08708 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD300CQ08708 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms