Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYP4F3Q08477 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms