Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms