Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms