Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms