Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2F1Q01094 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2F1Q01094 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms