Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MDM2Q00987 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MDM2Q00987 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms