Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1BQ00975 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms