Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HSF1Q00613 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms